Sebbene sia l'isopropanolo che l'etanolo-isopropanolo siano composti da carbonio, idrogeno e ossigeno, le loro strutture molecolari differiscono. L'isopropanolo ha la formula molecolare CH3CH2CH2OH, che lo rende un composto organico saturo a tre-carbonio, mentre l'isopropanolo dell'etanolo ha la formula molecolare (CH3)2CHOH, che lo rende un composto organico contenente un atomo di carbonio chirale.
I punti di ebollizione differiscono: l'isopropanolo bolle a 97,2 gradi, mentre l'etanolo e l'isopropanolo bolle a 82,4 gradi. A temperatura ambiente, l'isopropanolo è un liquido incolore e trasparente, mentre l'etanolo è un liquido giallo pallido.
La solubilità è diversa: a causa delle loro diverse strutture molecolari, l'isopropanolo e l'etanolo sono diversamente solubili. L'isopropanolo ha una solubilità del 10,6% (in volume) in acqua, mentre l'isopropanolo dell'etanolo ha una solubilità maggiore, raggiungendo il 50% (in volume).
Acidità/equilibrio: sia l'isopropanolo che l'etanolo sono alcoli, possiedono un'acidità moderata e sono in grado di subire reazioni catalizzate da basi-.
